나무 구조로 계층화된 파일 시스템의 디렉터리구조에서 가장 위쪽의 출발점이 되는 디렉터리. 이 뿌리 디렉터리로부터 다른 디렉터리로 갈라져 나간다. 그림은 MS-DOS 운영 체계의 한 디렉터리 구조로서 뿌리 디렉터리는 백슬래시(＼)로 표시되며, 뿌리 디렉터리 밑에 MYDATA라는 디렉터리가 있고 그 밑에 LETTERS 및 REPORTS라는 2개의 디렉터리가 있다.

 

웹서버에서는 웹의 기본페이지가 나타나는 임의의 물리적 위치를 뿌리 디렉토리라고 하며, 기본적으로 웹페이지는 이 디렉토리 아래에만 존재하게 된다.